Questa importante raccolta di sculture e pitture fu istituita in origine come Museo didattico per gli studenti che frequentavano la attigua Accademia di Belle Arti.

Essa comprende un considerevole numero di tavole e tele dal Trecento al Cinquecento e fra le opere rinascimentali si segnalano quelle del Botticelli, del Perugino, del Pontormo, ma soprattutto è famosa per lo straordinario gruppo di sculture michelangiolesche.