A destra della grandiosa tribuna terminale, la Cappella Strozzi è ornata di pregevolissimi affreschi, lavorati nel 1502 da Filippino Lippi, figlio del più famoso Filippo.

Essi, con un' esuberante fantasia, un forte dinamismo ed un'alta carica espressiva, narrano le storie di S. Giovanni Evangelista e di S. Filippo. Questi dipinti, inoltre, sono esaltati da una ricchissima decorazione e da complicate architetture che con grande originalità rielaborano gli elementi classici.
L'ampia tribuna è invece ornata da affreschi con le storie della Vergine Maria e di S. Giovanni Battista, eseguiti tra il 1485 ed il 1490, da Domenico Ghirlandaio, che qui dà un saggio compiuto del suo stile: facile, narrativo e altamente ornamentale.
Del Ghirlandaio è pure la vetrata del finestrone che costituisce così l'organico completamento di questo suo ciclo pittorico.